В целях поощрения молодых и талантливых ученых ВНИИТФ за фундаментальные и прикладные научные исследования, актуальные и интересные с научной точки зрения, а также имеющие важное значение для ядерного центра, с 1998 года учреждены премии РФЯЦ-ВНИИТФ имени выдающихся ученых, работавших на предприятии:
- премия имени Е.И. Забабахина за лучшую работу;
- премия имени В.З. Нечая в области теоретической физики;
- премия имени А.А. Бунатяна в области математики и вычислительной техники;
- премия имени И.В. Санина в области экспериментальных исследований газодинамических процессов и баллистики;
- премия имени Ю.А. Зысина в области экспериментальной физики;
- премия имени А.Д. Захаренкова в области разработки систем управления, приборов автоматики и контроля;
- премия имени Г.П. Ломинского в области технологии и экспериментальной отработки;
- премия имени Б.В. Литвинова;
- премия имени выдающегося организатора производства, первого директора института Д.Е. Васильева в целях поощрения молодых специалистов и рабочих РФЯЦ-ВНИИТФ, внесших наибольший вклад в организацию производства, изготовление изделий и выполнение работ производственно-технического характера, имеющих для института важное значение.
Премии присуждаются за отдельные научные работы, открытия, изобретения, а также за серии научных работ единой тематики, опубликованные в виде отчетов, статей, книг. Отбор работ производится конкурсными комиссиями, а окончательное решение о победителях конкурса принимается тайным голосованием на заседании НТС РФЯЦ - ВНИИТФ после заслушивания докладов претендентов, их обсуждения и на основании предложений конкурсных комиссий.
Денежные премии, почетные дипломы лауреатов и значки «Лауреат премии» вручаются победителям на торжественном совместном заседании научно-технического и технического советов института, которое проводится в конце года.
Лауреаты прошлых лет успешно защищают кандидатские диссертации, получают премии Госкорпорации «Росатом» для молодых ученых и их научных руководителей, премии Правительства РФ для молодых ученых, а также стипендии Президента РФ для работников организаций оборонно-промышленного комплекса.